呼吸道感染在SLE患者中发病率很高，基于以下原因：首先，红斑狼疮患者免疫功能紊乱，肺泡巨噬细胞抗菌活性低下；其次，激素和其它免疫抑制剂的使用；第三，肺水肿、呼吸肌无力等因素加重感染。呼吸道感染是SLE发病和死亡的重要原因，仅次于败血症和肾功能衰竭。因此对SLE患者任何新出现的肺部浸润都必须首先重点除外肺部感染，尤其是激素和免疫抑制剂治疗者。
无论普通细菌或条件致病菌均可导致SLE肺部感染。红斑狼疮患者机会性感染包括曲霉菌病、隐球菌病、卡氏肺囊虫感染、巨细胞病毒感染以及奴卡氏菌感染等。临床工作中尤其应注意警惕真菌和结核感染。结核是直接导致红斑狼疮死亡的原因之一。有研究表明SLE患者结核发病率为5%，但由于诊断的延迟，粟粒性肺结核及肺外结核的发病率更高。
由于某些肺部感染的表现常常易与SLE肺部受累的表现混淆，造成鉴别诊断的极大困难。例如结核引起的消瘦、发热等症状也可能是SLE的首发症状或病情活动的表现；卡氏肺囊虫感染可引起双肺弥漫以间质为主的毛玻璃样渗出或实变影，易与ALP混淆；肺部侵袭性曲霉菌感染所致咯血、低氧血症也难以与DAH相鉴别。积极完善影像学、痰病原学、支气管镜及肺泡灌洗液、肺活检等检查有助于肺部感染与红斑狼疮肺部受累的鉴别。
红斑狼疮肺部感染常常与红斑狼疮病情活动相伴随，抗感染治疗与原发病的治疗两者均需要兼顾。临床工作中需强调结合患者实际情况采取抗感染治疗或原发病治疗为主或两者并重的治疗方案。
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